AC177813.2-Contig117 217 270 1 54 AC177813.2-Contig117 dagaf_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.99 unclassified LTR 1 822 6655 AC177813.2-Contig154 1047 1134 1 88 AC177813.2-Contig154 ji_573L14-2hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 5 6046 39014 AC177813.2-Contig154 10690 10963 1 274 AC177813.2-Contig154 Zm1S_85L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 10745 12701 15852 AC177813.2-Contig155 1624 1670 1 47 AC177813.2-Contig155 dagaf_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.99 unclassified LTR 1 4937 38150 AC177813.2-Contig155 3687 3740 1 54 AC177813.2-Contig155 dagaf_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.99 unclassified LTR 1 4937 38150 AC177813.2-Contig167 916 965 1 50 AC177813.2-Contig167 Zm_AC148110.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1 7863 22743 AC177813.2-Contig167 4122 4257 1 136 AC177813.2-Contig167 Zm_AC148110.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1 7863 22743 AC177813.2-Contig167 11405 11509 1 105 AC177813.2-Contig167 Zm9L_81L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 11326 11721 674 AC177813.2-Contig167 24338 24533 1 196 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 24697 24763 2 67 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 25266 25439 1 174 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 25845 25906 1 62 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 26015 26246 13 232 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 26783 26918 1 136 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 27092 27183 2 92 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 27524 27643 6 120 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 27886 27988 2 103 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 28040 28090 1 51 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 28174 28346 3 173 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 28690 28792 3 103 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 29054 29160 5 107 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 29577 29636 1 60 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 29837 30192 3 356 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 30574 30647 1 74 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 30808 30893 1 86 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 31092 31143 1 52 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 31277 31338 1 62 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig167 31344 31489 4 146 AC177813.2-Contig167 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23905 32886 83076 AC177813.2-Contig174 328 399 2 72 AC177813.2-Contig174 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 30 5976 28682 AC177813.2-Contig174 649 708 1 60 AC177813.2-Contig174 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 30 5976 28682 AC177813.2-Contig174 856 905 1 50 AC177813.2-Contig174 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 30 5976 28682 AC177813.2-Contig174 1766 1814 1 49 AC177813.2-Contig174 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 30 5976 28682 AC177813.2-Contig174 2180 2247 2 68 AC177813.2-Contig174 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 30 5976 28682 AC177813.2-Contig174 4981 5031 1 51 AC177813.2-Contig174 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 30 5976 28682 AC177813.2-Contig174 5282 5386 1 105 AC177813.2-Contig174 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 30 5976 28682 AC177813.2-Contig174 10234 10359 2 126 AC177813.2-Contig174 NO_REPEATS AC177813.2-Contig174 11067 11301 1 235 AC177813.2-Contig174 NO_REPEATS AC177813.2-Contig174 11466 11636 1 171 AC177813.2-Contig174 NO_REPEATS AC177813.2-Contig174 22187 22237 1 51 AC177813.2-Contig174 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 16423 22671 30559 AC177813.2-Contig174 23251 23351 1 101 AC177813.2-Contig174 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 23146 26954 30090 AC177813.2-Contig174 29952 30168 1 217 AC177813.2-Contig174 NO_REPEATS AC177813.2-Contig174 30759 30946 1 188 AC177813.2-Contig174 NO_REPEATS AC177813.2-Contig174 46553 46619 2 67 AC177813.2-Contig174 opie_ac146764-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 46134 47409 11513 AC177813.2-Contig177 12687 12738 1 52 AC177813.2-Contig177 cinful_ac116033-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 10946 20544 83015 AC177813.2-Contig177 18668 18744 3 77 AC177813.2-Contig177 cinful_ac116033-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 10946 20544 83015 AC177813.2-Contig177 19745 19797 1 53 AC177813.2-Contig177 cinful_ac116033-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 10946 20544 83015 AC177813.2-Contig177 19907 19962 1 56 AC177813.2-Contig177 cinful_ac116033-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 10946 20544 83015 AC177813.2-Contig177 21526 21624 2 99 AC177813.2-Contig177 Zm_AC146764.6_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.98 other copia 21506 22787 11819 AC177813.2-Contig177 21896 22111 3 216 AC177813.2-Contig177 Zm_AC146764.6_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.98 other copia 21506 22787 11819 AC177813.2-Contig177 22246 22409 1 164 AC177813.2-Contig177 Zm_AC146764.6_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.98 other copia 21506 22787 11819 AC177813.2-Contig177 22533 22683 4 151 AC177813.2-Contig177 Zm_AC146764.6_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.98 other copia 21506 22787 11819 AC177813.2-Contig177 24532 24590 2 59 AC177813.2-Contig177 Zm_AC146814.6_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 22981 27209 30712 AC177813.2-Contig177 28533 28602 1 70 AC177813.2-Contig177 ji_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 27520 32609 39005 AC177813.2-Contig177 28831 28900 10 70 AC177813.2-Contig177 ji_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 27520 32609 39005 AC177813.2-Contig177 29358 29457 1 100 AC177813.2-Contig177 ji_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 27520 32609 39005 AC177813.2-Contig177 29659 29929 1 271 AC177813.2-Contig177 ji_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 27520 32609 39005 AC177813.2-Contig177 31100 31163 1 64 AC177813.2-Contig177 ji_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 27520 32609 39005 AC177813.2-Contig177 31504 31610 6 107 AC177813.2-Contig177 ji_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 27520 32609 39005 AC177813.2-Contig21 195 300 9 106 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig21 301 350 1 50 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig21 351 400 1 50 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig21 404 452 1 49 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig21 672 723 1 52 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig21 1445 1722 2 278 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig21 4431 4500 1 70 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig21 4501 4566 1 66 AC177813.2-Contig21 Zm9L_77L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 4714 38192 AC177813.2-Contig28 6556 6645 1 90 AC177813.2-Contig28 Zm9L_112L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 5814 7973 13603 AC177813.2-Contig28 12880 12942 1 63 AC177813.2-Contig28 prem1_af090447-2hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 9853 13017 12004 AC177813.2-Contig28 15369 15483 1 115 AC177813.2-Contig28 Zm9L_69L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15351 15518 1248 AC177813.2-Contig28 20700 20754 1 55 AC177813.2-Contig28 Zm1S_40L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 16043 23100 54589 AC177813.2-Contig28 25858 25910 2 53 AC177813.2-Contig28 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 22101 29366 43334 AC177813.2-Contig28 25928 25975 1 48 AC177813.2-Contig28 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 22101 29366 43334 AC177813.2-Contig28 27671 27731 1 61 AC177813.2-Contig28 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 22101 29366 43334 AC177813.2-Contig28 27791 27843 1 53 AC177813.2-Contig28 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 22101 29366 43334 AC177813.2-Contig28 37018 37146 5 129 AC177813.2-Contig28 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 36611 45196 27404 AC177813.2-Contig28 37501 37568 2 68 AC177813.2-Contig28 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 36611 45196 27404 AC177813.2-Contig28 40601 40705 1 105 AC177813.2-Contig28 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 36611 45196 27404 AC177813.2-Contig28 40817 40924 2 108 AC177813.2-Contig28 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 36611 45196 27404 AC177813.2-Contig28 43187 43239 1 53 AC177813.2-Contig28 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 36611 45196 27404 AC177813.2-Contig28 43945 43987 1 43 AC177813.2-Contig28 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 36611 45196 27404 AC177813.2-Contig28 44010 44086 1 77 AC177813.2-Contig28 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 36611 45196 27404 AC177814.3-Contig40 689 755 1 67 AC177814.3-Contig40 huck_ac145728-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 18 2929 22146 AC177814.3-Contig40 758 809 1 52 AC177814.3-Contig40 huck_ac145728-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 18 2929 22146 AC177814.3-Contig40 825 927 2 103 AC177814.3-Contig40 huck_ac145728-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 18 2929 22146 AC177814.3-Contig40 2524 2586 3 63 AC177814.3-Contig40 huck_ac145728-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 18 2929 22146 AC177814.3-Contig40 2648 2698 1 51 AC177814.3-Contig40 huck_ac145728-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 18 2929 22146 AC177814.3-Contig41 1706 1767 1 62 AC177814.3-Contig41 ji_576C20-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 701 2357 12357 AC177814.3-Contig41 2573 2629 3 57 AC177814.3-Contig41 Zm1S_102L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 2358 2912 4451 AC177814.3-Contig42 651 838 1 188 AC177814.3-Contig42 giepum_333J11-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 18 1941 17361 AC177814.3-Contig42 1007 1176 2 170 AC177814.3-Contig42 giepum_333J11-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 18 1941 17361 AC177814.3-Contig42 1248 1392 2 145 AC177814.3-Contig42 giepum_333J11-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 18 1941 17361 AC177814.3-Contig42 1564 1633 2 70 AC177814.3-Contig42 giepum_333J11-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 18 1941 17361 AC177814.3-Contig43 325 381 3 57 AC177814.3-Contig43 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 11 594 4105 AC177814.3-Contig43 464 524 1 61 AC177814.3-Contig43 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 11 594 4105 AC177814.3-Contig43 640 691 1 52 AC177814.3-Contig43 Zm9L_109L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 595 1096 4042 AC177814.3-Contig43 903 999 2 97 AC177814.3-Contig43 Zm9L_109L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 595 1096 4042 AC177814.3-Contig43 1804 1864 1 61 AC177814.3-Contig43 Zm9L_65L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1097 2659 11127 AC177814.3-Contig43 2386 2431 1 46 AC177814.3-Contig43 Zm9L_65L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1097 2659 11127 AC177814.3-Contig43 2707 2755 2 49 AC177814.3-Contig43 Zm_AC148103.3_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 2660 3434 6233 AC177814.3-Contig43 3182 3410 5 229 AC177814.3-Contig43 Zm_AC148103.3_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 2660 3434 6233 AC177814.3-Contig44 2462 2614 3 153 AC177814.3-Contig44 NO_REPEATS AC177814.3-Contig44 2615 2853 6 239 AC177814.3-Contig44 NO_REPEATS AC177814.3-Contig44 2901 2987 2 87 AC177814.3-Contig44 NO_REPEATS AC177814.3-Contig44 5571 5729 1 159 AC177814.3-Contig44 NO_REPEATS AC177814.3-Contig44 6682 6817 1 136 AC177814.3-Contig44 NO_REPEATS AC177814.3-Contig45 3423 3530 1 108 AC177814.3-Contig45 NO_REPEATS AC177814.3-Contig45 4677 4949 6 273 AC177814.3-Contig45 Zm_AC148168.6_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 3827 5857 13872 AC177814.3-Contig45 5732 5791 1 60 AC177814.3-Contig45 Zm_AC148168.6_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 3827 5857 13872 AC177814.3-Contig45 7204 7265 2 62 AC177814.3-Contig45 Zm9L_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7050 12718 46725 AC177814.3-Contig45 8051 8122 1 72 AC177814.3-Contig45 Zm9L_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7050 12718 46725 AC177814.3-Contig45 9819 9949 4 131 AC177814.3-Contig45 Zm9L_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7050 12718 46725 AC177814.3-Contig45 9988 10083 1 96 AC177814.3-Contig45 Zm9L_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7050 12718 46725 AC177814.3-Contig45 11138 11288 3 151 AC177814.3-Contig45 Zm9L_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7050 12718 46725 AC177814.3-Contig45 11320 11371 5 52 AC177814.3-Contig45 Zm9L_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7050 12718 46725 AC177814.3-Contig45 11495 11544 1 50 AC177814.3-Contig45 Zm9L_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7050 12718 46725 AC177814.3-Contig46 2332 2388 3 57 AC177814.3-Contig46 ji_576C20-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 34 3316 23952 AC177814.3-Contig46 6676 6730 1 55 AC177814.3-Contig46 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 3317 7658 36597 AC177814.3-Contig46 6831 6908 1 78 AC177814.3-Contig46 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 3317 7658 36597 AC177814.3-Contig46 8500 8555 3 56 AC177814.3-Contig46 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7659 9133 11231 AC177814.3-Contig46 9354 9409 1 56 AC177814.3-Contig46 ji_ac148179-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 9134 11621 20722 AC177814.3-Contig46 14096 14169 1 74 AC177814.3-Contig46 Zm_AC148173.2_7L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 11622 14955 25735 AC177814.3-Contig47 3832 3893 2 62 AC177814.3-Contig47 ji_576C20-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 234 5106 34329 AC177814.3-Contig47 5627 5683 2 57 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 6299 6404 3 106 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 6600 6650 1 51 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 8410 8508 1 99 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 8676 8748 12 73 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 8917 8985 1 69 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 9146 9217 2 72 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 9294 9398 4 105 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 9616 9681 1 66 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 9873 9967 1 95 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 10421 10468 1 48 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 10601 10660 3 60 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 10712 10768 1 57 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 10811 10882 2 72 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 11136 11206 3 71 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 11265 11325 1 61 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 13499 13548 1 50 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 14472 14610 1 139 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 14721 14797 3 77 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 14827 14876 1 50 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 14881 15055 10 175 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig47 15083 15182 3 100 AC177814.3-Contig47 huck_573L14-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5107 16785 53164 AC177814.3-Contig48 19996 20132 1 137 AC177814.3-Contig48 CRATA MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05.01.06.07 hat 19999 20094 251 AC177814.3-Contig48 22365 22419 1 55 AC177814.3-Contig48 Zm_AC148173.2_7L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 22181 27446 40336 AC177814.3-Contig48 26083 26167 2 85 AC177814.3-Contig48 Zm_AC148173.2_7L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 22181 27446 40336 AC177814.3-Contig48 26172 26283 1 112 AC177814.3-Contig48 Zm_AC148173.2_7L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 22181 27446 40336 AC177814.3-Contig48 27661 27717 3 57 AC177814.3-Contig48 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 27447 28976 13061 AC177814.3-Contig48 37277 37333 1 57 AC177814.3-Contig48 Zm_AC146973.6_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 28977 38675 75150 AC177814.3-Contig48 38859 38920 1 62 AC177814.3-Contig48 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 38676 39510 7003 AC177814.3-Contig49 4100 4159 1 60 AC177814.3-Contig49 NO_REPEATS AC177814.3-Contig49 4293 4382 1 90 AC177814.3-Contig49 NO_REPEATS AC177814.3-Contig49 6458 6513 1 56 AC177814.3-Contig49 Zm_AC148394.3_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5425 7055 12481 AC177814.3-Contig49 6832 6882 1 51 AC177814.3-Contig49 Zm_AC148394.3_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 5425 7055 12481 AC177814.3-Contig49 8245 8299 3 55 AC177814.3-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7670 21958 92953 AC177814.3-Contig49 9575 9635 4 61 AC177814.3-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7670 21958 92953 AC177814.3-Contig49 11474 11524 1 51 AC177814.3-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7670 21958 92953 AC177814.3-Contig49 14162 14277 4 116 AC177814.3-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7670 21958 92953 AC177814.3-Contig49 15906 15953 1 48 AC177814.3-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7670 21958 92953 AC177814.3-Contig49 16693 16748 1 56 AC177814.3-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7670 21958 92953 AC177814.3-Contig49 24865 24924 1 60 AC177814.3-Contig49 TNR2A MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 24820 24882 239 AC177814.3-Contig49 27534 27589 1 56 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 27626 27687 1 62 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 28177 28260 1 84 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 28868 28929 1 62 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 29156 29265 4 110 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 29267 29325 1 59 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 29394 29487 1 94 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 30111 30202 2 92 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 30487 30565 2 79 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 30592 30660 3 69 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 30662 30743 3 82 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 30905 30959 1 55 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 31419 31540 2 122 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 31625 31811 4 187 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 32036 32177 6 142 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 32178 32250 2 73 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 32576 32631 1 56 AC177814.3-Contig49 Zm1S_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 26918 35902 49917 AC177814.3-Contig49 42596 42658 1 63 AC177814.3-Contig49 ji_576C20-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 42017 46186 31188 AC177814.3-Contig49 43684 43745 1 62 AC177814.3-Contig49 ji_576C20-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 42017 46186 31188 AC177814.3-Contig49 44485 44558 1 74 AC177814.3-Contig49 ji_576C20-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 42017 46186 31188 AC177814.3-Contig49 45152 45208 3 57 AC177814.3-Contig49 ji_576C20-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 42017 46186 31188 AC177814.3-Contig49 45459 45562 1 104 AC177814.3-Contig49 ji_576C20-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 42017 46186 31188 AC177814.3-Contig49 49691 49750 1 60 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 50784 50927 3 144 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 51756 51853 2 98 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 51874 52060 2 187 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 54067 54187 3 121 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 54716 54832 1 117 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 54969 55038 1 70 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 55247 55319 2 73 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 55618 55690 2 73 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 55949 56050 2 102 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 56595 56652 2 58 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 57276 57392 1 117 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 57988 58314 7 327 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 58315 58384 2 70 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 58578 58677 4 100 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 58855 59080 2 226 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 59106 59182 3 77 AC177814.3-Contig49 giepum_ac149034-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 49142 60918 100204 AC177814.3-Contig49 73109 73174 1 66 AC177814.3-Contig49 NO_REPEATS AC177814.3-Contig49 78387 78514 1 128 AC177814.3-Contig49 Os8_06_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.02.05 LINE 77285 79929 1882 AC177814.3-Contig49 78515 78571 1 57 AC177814.3-Contig49 Os8_06_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.02.05 LINE 77285 79929 1882 AC177814.3-Contig49 88440 88510 1 71 AC177814.3-Contig49 NO_REPEATS AC177814.3-Contig49 95617 95749 1 133 AC177814.3-Contig49 ORSiTEMT05300001 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05.02.01.43 Micron 95535 95657 524 AC177814.3-Contig49 95773 95835 1 63 AC177814.3-Contig49 NO_REPEATS AC177814.3-Contig49 95896 95949 1 54 AC177814.3-Contig49 NO_REPEATS AC177815.2-Contig66 34 240 1 207 AC177815.2-Contig66 Zm_AC146796.5_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 211 342 399 AC177815.2-Contig66 3210 3360 1 151 AC177815.2-Contig66 prem1_af090447-2hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 405 5525 14593 AC177815.2-Contig66 31424 31499 1 76 AC177815.2-Contig66 NO_REPEATS AC177815.2-Contig66 36539 36718 1 180 AC177815.2-Contig66 NO_REPEATS AC177815.2-Contig66 53810 53863 1 54 AC177815.2-Contig66 Zm_AC148162.5_2B_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01 Class I: Retroelement 53223 53837 3687 AC177815.2-Contig66 57865 58066 1 202 AC177815.2-Contig66 k_52 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 57434 58139 4275 AC177815.2-Contig66 64354 64403 1 50 AC177815.2-Contig66 NO_REPEATS AC177815.2-Contig66 64442 64549 1 108 AC177815.2-Contig66 Zm9L_56L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 64431 65242 838 AC177815.2-Contig66 72005 72056 4 52 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 72228 72311 1 84 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 72920 72980 1 61 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 73071 73207 5 137 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 73317 73382 2 66 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 73446 73539 1 94 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 73563 73665 3 103 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 74052 74111 1 60 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 74634 74715 5 82 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 74958 75012 1 55 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 75112 75162 1 51 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 75428 75513 2 86 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 75762 75864 3 103 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 76233 76406 3 174 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 76853 77093 1 241 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 77763 77954 2 192 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 80793 80851 2 59 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 83597 83669 1 73 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 84509 84560 1 52 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 84598 84709 1 112 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 84747 84831 1 85 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 85007 85056 1 50 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 88288 88346 1 59 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 89241 89306 1 66 AC177815.2-Contig66 ji_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 71005 89808 69056 AC177815.2-Contig66 101138 101200 1 63 AC177815.2-Contig66 zeon_ac146795-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 99981 107357 58060 AC177815.2-Contig66 101541 101602 1 62 AC177815.2-Contig66 zeon_ac146795-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 99981 107357 58060 AC177815.2-Contig66 117559 117594 1 36 AC177815.2-Contig66 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 114855 128265 86365 AC177815.2-Contig66 119017 119070 2 54 AC177815.2-Contig66 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 114855 128265 86365 AC177815.2-Contig66 119195 119255 1 61 AC177815.2-Contig66 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 114855 128265 86365 AC177815.2-Contig66 120380 120431 1 52 AC177815.2-Contig66 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 114855 128265 86365 AC177815.2-Contig66 121032 121088 2 57 AC177815.2-Contig66 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 114855 128265 86365 AC177815.2-Contig66 124384 124429 1 46 AC177815.2-Contig66 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 114855 128265 86365 AC177815.2-Contig66 138702 138776 1 75 AC177815.2-Contig66 ZRSiTERTOOT00132 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 138480 141814 11740 AC177815.2-Contig66 138777 138919 1 143 AC177815.2-Contig66 ZRSiTERTOOT00132 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 138480 141814 11740 AC177815.2-Contig66 152216 152279 1 64 AC177815.2-Contig66 NO_REPEATS AC177815.2-Contig66 157170 157226 1 57 AC177815.2-Contig66 ZRSiTERT00300004 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.02.05 LINE 157186 157267 229 AC177815.2-Contig66 159295 159348 1 54 AC177815.2-Contig66 NO_REPEATS AC177815.2-Contig66 159352 159409 1 58 AC177815.2-Contig66 NO_REPEATS AC177815.2-Contig66 173112 173165 1 54 AC177815.2-Contig66 zeon_ac147813-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 167620 175001 56602 AC177816.2-Contig104 3396 3462 1 67 AC177816.2-Contig104 NO_REPEATS AC177816.2-Contig104 7745 7812 1 68 AC177816.2-Contig104 NO_REPEATS AC177816.2-Contig104 8131 8260 1 130 AC177816.2-Contig104 NO_REPEATS AC177816.2-Contig104 14008 14063 1 56 AC177816.2-Contig104 NO_REPEATS AC177816.2-Contig104 21093 21130 1 38 AC177816.2-Contig104 Zm1S_9L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20440 21983 11767 AC177816.2-Contig120 1035 1087 1 53 AC177816.2-Contig120 Zm1S_9L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 8245 65832 AC177816.2-Contig120 4779 4948 1 170 AC177816.2-Contig120 Zm1S_9L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 8245 65832 AC177816.2-Contig120 6477 6526 1 50 AC177816.2-Contig120 Zm1S_9L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 8245 65832 AC177816.2-Contig120 15176 15282 1 107 AC177816.2-Contig120 zeon_Z178A11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 13923 15320 4441 AC177816.2-Contig120 44436 44502 1 67 AC177816.2-Contig120 zeon_ac148479-2hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 43972 44802 5019 AC177816.2-Contig120 50389 50445 2 57 AC177816.2-Contig120 Zm_AC148169.2_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 47760 53989 49873 AC177816.2-Contig120 51192 51248 1 57 AC177816.2-Contig120 Zm_AC148169.2_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 47760 53989 49873 AC177816.2-Contig120 51281 51335 1 55 AC177816.2-Contig120 Zm_AC148169.2_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 47760 53989 49873 AC177816.2-Contig120 51593 51663 1 71 AC177816.2-Contig120 Zm_AC148169.2_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 47760 53989 49873 AC177816.2-Contig120 52539 52640 2 102 AC177816.2-Contig120 Zm_AC148169.2_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 47760 53989 49873 AC177816.2-Contig18 2447 2544 1 98 AC177816.2-Contig18 Zm_AC147809.5_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 1 5010 37315 AC177816.2-Contig18 3960 4009 1 50 AC177816.2-Contig18 Zm_AC147809.5_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 1 5010 37315 AC177816.2-Contig18 14057 14125 3 69 AC177816.2-Contig18 zeon_ac148479-2hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 13116 14423 6705 AC177816.2-Contig18 26053 26109 1 57 AC177816.2-Contig18 Zm_AC148112.7_7L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 24627 26512 13396 AC177816.2-Contig18 32417 32467 1 51 AC177816.2-Contig18 prem1_af090447-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 30631 35767 32782 AC177816.2-Contig18 36926 37068 1 143 AC177816.2-Contig18 Zm1S_76L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 35773 44670 67360 AC177816.2-Contig18 38014 38066 2 53 AC177816.2-Contig18 Zm1S_76L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 35773 44670 67360 AC177816.2-Contig18 38272 38334 2 63 AC177816.2-Contig18 Zm1S_76L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 35773 44670 67360 AC177816.2-Contig18 38360 38458 1 99 AC177816.2-Contig18 Zm1S_76L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 35773 44670 67360 AC177816.2-Contig18 38950 39005 1 56 AC177816.2-Contig18 Zm1S_76L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 35773 44670 67360 AC177816.2-Contig18 39728 39792 1 65 AC177816.2-Contig18 Zm1S_76L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 35773 44670 67360 AC177816.2-Contig18 46291 46336 1 46 AC177816.2-Contig18 Zm1S_82L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 45904 46430 1460 AC177816.2-Contig18 47581 47626 1 46 AC177816.2-Contig18 cinful_Z195D10-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 46444 55808 74595 AC177816.2-Contig18 48182 48235 1 54 AC177816.2-Contig18 cinful_Z195D10-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 46444 55808 74595 AC177816.2-Contig18 49436 49549 1 114 AC177816.2-Contig18 cinful_Z195D10-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 46444 55808 74595 AC177816.2-Contig18 50661 50730 1 70 AC177816.2-Contig18 cinful_Z195D10-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 46444 55808 74595 AC177817.3-Contig13 1259 1328 1 70 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 1588 1642 1 55 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 1939 1998 1 60 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 2638 2687 1 50 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 2763 2902 8 140 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 2903 2951 1 49 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 3003 3196 3 194 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 4049 4122 1 74 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 6240 6290 1 51 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 6321 6395 1 75 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 7023 7072 1 50 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 7075 7140 1 66 AC177817.3-Contig13 ji_333J11-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 41 7291 57886 AC177817.3-Contig13 7821 7974 1 154 AC177817.3-Contig13 Zm_AC148163.6_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7292 9133 14333 AC177817.3-Contig13 11382 11512 2 131 AC177817.3-Contig13 Zm_AC146813.3_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.06 grande 10504 16428 36431 AC177817.3-Contig14 924 972 1 49 AC177817.3-Contig14 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 23 3872 30705 AC177817.3-Contig14 2859 2909 1 51 AC177817.3-Contig14 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 23 3872 30705 AC177817.3-Contig14 3414 3779 3 366 AC177817.3-Contig14 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 23 3872 30705 AC177817.3-Contig16 3241 3308 5 68 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 4027 4112 2 86 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 4326 4375 1 50 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 4934 4998 2 65 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 5316 5376 1 61 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 5401 5494 1 94 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 6165 6221 1 57 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 6224 6276 2 53 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 6335 6387 1 53 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 7228 7311 1 84 AC177817.3-Contig16 opie_ac145481-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 699 8619 62684 AC177817.3-Contig16 15704 15788 1 85 AC177817.3-Contig16 ruda_464F01-2solo MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.99 unclassified LTR 14825 15911 8589 AC177817.3-Contig16 16685 16765 2 81 AC177817.3-Contig16 Zm_AC148093.6_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15908 18562 15112 AC177817.3-Contig16 21894 21941 1 48 AC177817.3-Contig16 Zm_AC147016.3_1L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 18583 25519 43749 AC177817.3-Contig16 24007 24059 1 53 AC177817.3-Contig16 Zm_AC147016.3_1L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 18583 25519 43749 AC177817.3-Contig16 33881 33985 1 105 AC177817.3-Contig16 Zm_AC148243.4_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 32630 34567 9196 AC177817.3-Contig16 34473 34533 1 61 AC177817.3-Contig16 Zm_AC148243.4_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 32630 34567 9196 AC177817.3-Contig16 37086 37233 1 148 AC177817.3-Contig16 Zm9L_76L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 36738 38035 10950 AC177817.3-Contig16 52485 52568 3 84 AC177817.3-Contig16 prem1_af090447-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 52472 54338 13461 AC177817.3-Contig16 57582 57646 1 65 AC177817.3-Contig16 Zm1S_55L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 55362 61539 43123 AC177817.3-Contig16 57658 57705 1 48 AC177817.3-Contig16 Zm1S_55L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 55362 61539 43123 AC177817.3-Contig16 69745 69795 1 51 AC177817.3-Contig16 ji_ac146973-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 69490 70148 5075 AC177817.3-Contig16 69826 69900 1 75 AC177817.3-Contig16 ji_ac146973-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 69490 70148 5075 AC177817.3-Contig38 7605 7778 1 174 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 8097 8253 4 157 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 8351 8471 1 121 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 8474 8646 6 173 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 8761 8927 2 167 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 9119 9254 1 136 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 9804 9961 4 158 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 10222 10276 1 55 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 10376 10426 1 51 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 10510 10682 3 173 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 11026 11097 2 72 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 11156 11299 1 144 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 11392 11622 12 231 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 11757 11867 1 111 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 12228 12556 6 329 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 12625 12752 1 128 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 12936 13079 1 144 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 13366 13464 2 99 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 13743 13853 3 111 AC177817.3-Contig38 Zm9L_19L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 6254 15230 76978 AC177817.3-Contig38 21689 21744 1 56 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 22705 22763 1 59 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 24126 24199 3 74 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 26207 26329 2 123 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 26683 26738 1 56 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 27028 27138 11 111 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 27139 27237 8 99 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 27697 27772 1 76 AC177817.3-Contig38 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20749 29318 47725 AC177817.3-Contig38 30515 30657 1 143 AC177817.3-Contig38 Zm1S_125L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 29324 32114 14966 AC177817.3-Contig38 31505 31631 1 127 AC177817.3-Contig38 Zm1S_125L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 29324 32114 14966 AC177817.3-Contig38 34644 34752 1 109 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 35775 35833 2 59 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 36287 36524 1 238 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 36536 36636 3 101 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 37152 37301 1 150 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 37590 37803 1 214 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 37809 37900 2 92 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 38399 38462 1 64 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig38 38748 38800 2 53 AC177817.3-Contig38 opie_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32115 41079 71718 AC177817.3-Contig43 3003 3369 3 367 AC177817.3-Contig43 prem1_573F08-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1719 3953 13071 AC177817.3-Contig43 3875 3925 1 51 AC177817.3-Contig43 prem1_573F08-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1719 3953 13071 AC177817.3-Contig43 6060 6114 1 55 AC177817.3-Contig43 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 4027 6662 20242 AC177817.3-Contig43 25060 25220 1 161 AC177817.3-Contig43 opie_af090447-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 24642 25618 1507 AC177817.3-Contig43 30599 30703 1 105 AC177817.3-Contig43 eninu_013I05-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05 Ty1/copia 28406 35622 53801 AC177817.3-Contig43 30983 31041 1 59 AC177817.3-Contig43 eninu_013I05-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05 Ty1/copia 28406 35622 53801 AC177817.3-Contig43 35824 35872 1 49 AC177817.3-Contig43 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 35791 37441 11594 AC177817.3-Contig43 44716 44840 1 125 AC177817.3-Contig43 Zm1S_138L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 43086 45403 12002 AC177817.3-Contig43 56244 56333 2 90 AC177817.3-Contig43 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 46639 57799 73855 AC177817.3-Contig43 61726 61801 1 76 AC177817.3-Contig43 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 59001 66074 55502 AC177817.3-Contig43 62628 62686 1 59 AC177817.3-Contig43 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 59001 66074 55502 AC177817.3-Contig43 65076 65132 1 57 AC177817.3-Contig43 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 59001 66074 55502 AC177818.0-Contig111 4248 4394 2 147 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 5380 5582 2 203 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 7509 7581 1 73 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 10413 10465 1 53 AC177818.4-Contig111 ji_ac148081-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10397 13841 26665 AC177818.0-Contig111 10549 10610 2 62 AC177818.4-Contig111 ji_ac148081-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10397 13841 26665 AC177818.0-Contig111 12793 12850 1 58 AC177818.4-Contig111 ji_ac148081-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10397 13841 26665 AC177818.0-Contig111 13637 13697 2 61 AC177818.4-Contig111 ji_ac148081-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10397 13841 26665 AC177818.0-Contig111 19147 19256 2 110 AC177818.4-Contig111 zeon_ac147016-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 13842 21204 48935 AC177818.0-Contig111 21710 21766 5 57 AC177818.4-Contig111 ji_ac145227-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 21205 23160 16236 AC177818.0-Contig111 21834 21901 1 68 AC177818.4-Contig111 ji_ac145227-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 21205 23160 16236 AC177818.0-Contig111 22026 22133 7 108 AC177818.4-Contig111 ji_ac145227-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 21205 23160 16236 AC177818.0-Contig111 22135 22193 3 59 AC177818.4-Contig111 ji_ac145227-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 21205 23160 16236 AC177818.0-Contig111 22259 22361 2 103 AC177818.4-Contig111 ji_ac145227-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 21205 23160 16236 AC177818.0-Contig111 23078 23148 2 71 AC177818.4-Contig111 ji_ac145227-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 21205 23160 16236 AC177818.0-Contig111 23232 23289 1 58 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 23161 25770 19311 AC177818.0-Contig111 23974 24025 1 52 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 23161 25770 19311 AC177818.0-Contig111 24131 24185 1 55 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 23161 25770 19311 AC177818.0-Contig111 25587 25638 1 52 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 23161 25770 19311 AC177818.0-Contig111 26252 26301 1 50 AC177818.4-Contig111 huck_af546188-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25771 32384 50453 AC177818.0-Contig111 26430 26485 1 56 AC177818.4-Contig111 huck_af546188-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25771 32384 50453 AC177818.0-Contig111 29574 29633 4 60 AC177818.4-Contig111 huck_af546188-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25771 32384 50453 AC177818.0-Contig111 30245 30320 1 76 AC177818.4-Contig111 huck_af546188-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25771 32384 50453 AC177818.0-Contig111 30923 31056 2 134 AC177818.4-Contig111 huck_af546188-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25771 32384 50453 AC177818.0-Contig111 32888 32953 2 66 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 32986 33044 1 59 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 33369 33424 1 56 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 36533 36671 2 139 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 38218 38311 1 94 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 38975 39040 2 66 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 39043 39149 6 107 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 39150 39228 7 79 AC177818.4-Contig111 opie_af391808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32385 40891 51629 AC177818.0-Contig111 41312 41371 2 60 AC177818.4-Contig111 Zm_AC146763.2_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 40892 44290 19186 AC177818.0-Contig111 41615 41669 1 55 AC177818.4-Contig111 Zm_AC146763.2_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 40892 44290 19186 AC177818.0-Contig111 43616 43732 1 117 AC177818.4-Contig111 Zm_AC146763.2_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 40892 44290 19186 AC177818.0-Contig111 50231 50298 3 68 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145726.6_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 47632 55243 54126 AC177818.0-Contig111 53212 53272 2 61 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145726.6_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 47632 55243 54126 AC177818.0-Contig111 55275 55370 2 96 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145389.6_1L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 55244 57377 17655 AC177818.0-Contig111 55905 55954 1 50 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145389.6_1L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 55244 57377 17655 AC177818.0-Contig111 56678 56801 2 124 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145389.6_1L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 55244 57377 17655 AC177818.0-Contig111 56913 56962 6 50 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145389.6_1L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 55244 57377 17655 AC177818.0-Contig111 57062 57118 1 57 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145389.6_1L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 55244 57377 17655 AC177818.0-Contig111 59328 59380 1 53 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 58723 63330 35954 AC177818.0-Contig111 60963 61022 1 60 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 58723 63330 35954 AC177818.0-Contig111 61023 61098 1 76 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 58723 63330 35954 AC177818.0-Contig111 61536 61597 1 62 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 58723 63330 35954 AC177818.0-Contig111 61954 62010 1 57 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 58723 63330 35954 AC177818.0-Contig111 63028 63095 3 68 AC177818.4-Contig111 ji_ac148350-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 58723 63330 35954 AC177818.0-Contig111 63632 63682 1 51 AC177818.4-Contig111 ji_ac146973-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 63331 65229 15145 AC177818.0-Contig111 63683 63733 2 51 AC177818.4-Contig111 ji_ac146973-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 63331 65229 15145 AC177818.0-Contig111 64769 64821 1 53 AC177818.4-Contig111 ji_ac146973-3 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 63331 65229 15145 AC177818.0-Contig111 66036 66102 2 67 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 67590 67717 2 128 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 68348 68402 1 55 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 68502 68552 1 51 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 69655 69704 1 50 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 69753 69924 1 172 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 70017 70091 1 75 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 70550 70623 3 74 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 71468 71667 2 200 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 72049 72122 1 74 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 72367 72433 1 67 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 72477 72575 2 99 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 72854 72964 3 111 AC177818.4-Contig111 opie_ac146763-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65230 74375 50188 AC177818.0-Contig111 76147 76180 1 34 AC177818.4-Contig111 Zm1S_13L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 74376 76418 16501 AC177818.0-Contig111 79431 79524 1 94 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 79839 80106 4 268 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 89136 89212 1 77 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 89325 89545 15 221 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 91436 91479 1 44 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 100306 100387 1 82 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 101163 101288 1 126 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 104624 104664 1 41 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 111519 111674 1 156 AC177818.4-Contig111 NO_REPEATS AC177818.0-Contig111 127592 127661 1 70 AC177818.4-Contig111 ji_573L14-2hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 127255 128464 9832 AC177818.0-Contig111 128619 128677 2 59 AC177818.4-Contig111 Zm9L_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 128465 134866 51484 AC177818.0-Contig111 132023 132136 2 114 AC177818.4-Contig111 Zm9L_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 128465 134866 51484 AC177818.0-Contig111 132326 132463 3 138 AC177818.4-Contig111 Zm9L_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 128465 134866 51484 AC177818.0-Contig111 132611 132779 10 169 AC177818.4-Contig111 Zm9L_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 128465 134866 51484 AC177818.0-Contig111 134079 134150 2 72 AC177818.4-Contig111 Zm9L_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 128465 134866 51484 AC177818.0-Contig111 134896 134946 1 51 AC177818.4-Contig111 Zm_AC145226.4_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 134867 136047 10141 AC177818.0-Contig111 139203 139317 1 115 AC177818.4-Contig111 Zm1S_55L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 136311 144125 35971 AC177818.0-Contig111 140065 140112 1 48 AC177818.4-Contig111 Zm1S_55L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 136311 144125 35971 AC177818.0-Contig111 140657 140711 1 55 AC177818.4-Contig111 Zm1S_55L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 136311 144125 35971 AC177818.0-Contig111 146140 146216 1 77 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 147129 147184 1 56 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 147747 147805 2 59 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 148441 148491 1 51 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 150206 150260 1 55 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 150534 150594 2 61 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 150783 150878 2 96 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 151369 151430 1 62 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 151854 151903 1 50 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 152900 152973 1 74 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 153227 153283 1 57 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 155432 155491 1 60 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 155553 155622 10 70 AC177818.4-Contig111 Zm9L_70L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 145336 156749 73210 AC177818.0-Contig111 157023 157067 3 45 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177818.0-Contig111 157639 157674 1 36 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177818.0-Contig111 160786 160831 1 46 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177818.0-Contig111 161211 161270 1 60 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177818.0-Contig111 161416 161483 2 68 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177818.0-Contig111 165052 165149 1 98 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177818.0-Contig111 166023 166111 2 89 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177818.0-Contig111 168384 168582 1 199 AC177818.4-Contig111 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 156750 170411 106528 AC177819.2-Contig19 11401 11492 1 92 AC177819.2-Contig19 ji_334B07-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 8780 14433 43217 AC177819.2-Contig19 12728 12973 3 246 AC177819.2-Contig19 ji_334B07-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 8780 14433 43217 AC177819.2-Contig19 13037 13087 5 51 AC177819.2-Contig19 ji_334B07-4 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 8780 14433 43217 AC177819.2-Contig20 2068 2119 4 52 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 2148 2199 2 52 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 2363 2459 2 97 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 3578 3646 1 69 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 5371 5492 1 122 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 5493 5603 2 111 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 6197 6264 2 68 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 6563 6613 1 51 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 6713 6767 1 55 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 7107 7185 2 79 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 7472 7563 2 92 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 8062 8163 3 102 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 8345 8517 12 173 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 8569 8650 2 82 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 8699 8806 2 108 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig20 9411 9494 1 84 AC177819.2-Contig20 Zm1S_34L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1865 10740 79622 AC177819.2-Contig30 985 1151 1 167 AC177819.2-Contig30 Zm_AC146713.7_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 519 1518 4047 AC177819.2-Contig30 2509 2649 2 141 AC177819.2-Contig30 zeon_ac145727-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 1519 8913 50608 AC177819.2-Contig30 2726 2963 3 238 AC177819.2-Contig30 zeon_ac145727-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 1519 8913 50608 AC177819.2-Contig30 9182 9268 1 87 AC177819.2-Contig30 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 8914 10180 8537 AC177819.2-Contig30 16075 16121 1 47 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 16802 16870 3 69 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 17036 17105 10 70 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 19223 19292 1 70 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 19369 19429 3 61 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 19635 19788 8 154 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 20469 20555 2 87 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 20804 20853 1 50 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 20968 21026 1 59 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 21778 21909 4 132 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 22062 22122 2 61 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 22232 22354 3 123 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 24201 24261 1 61 AC177819.2-Contig30 ji_576C20-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 15710 25170 78055 AC177819.2-Contig30 25613 25668 1 56 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 26962 27022 1 61 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 27117 27423 24 307 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 27645 27706 2 62 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 28270 28349 1 80 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 28999 29053 1 55 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 29303 29352 1 50 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 29381 29426 1 46 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 29464 29584 3 121 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 29803 29905 3 103 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 30196 30272 1 77 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 31155 31197 1 43 AC177819.2-Contig30 Zm_AC149835.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 25171 33999 62826 AC177819.2-Contig30 38514 38600 1 87 AC177819.2-Contig30 NO_REPEATS AC177819.2-Contig30 38847 38934 1 88 AC177819.2-Contig30 NO_REPEATS AC177819.2-Contig30 39063 39320 2 258 AC177819.2-Contig30 NO_REPEATS AC177819.2-Contig30 42205 42277 1 73 AC177819.2-Contig30 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 41621 43154 10481 AC177819.2-Contig30 43883 43939 3 57 AC177819.2-Contig30 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 43154 44879 9952 AC177819.2-Contig30 46837 46895 1 59 AC177819.2-Contig30 opie_ac146812-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 44881 53765 71802 AC177819.2-Contig30 48506 48555 1 50 AC177819.2-Contig30 opie_ac146812-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 44881 53765 71802 AC177819.2-Contig30 48556 48629 3 74 AC177819.2-Contig30 opie_ac146812-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 44881 53765 71802 AC177819.2-Contig30 50986 51065 1 80 AC177819.2-Contig30 opie_ac146812-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 44881 53765 71802 AC177819.2-Contig30 51567 51625 1 59 AC177819.2-Contig30 opie_ac146812-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 44881 53765 71802 AC177819.2-Contig30 53483 53538 1 56 AC177819.2-Contig30 opie_ac146812-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 44881 53765 71802 AC177819.2-Contig30 56159 56255 1 97 AC177819.2-Contig30 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 53766 60960 55570 AC177819.2-Contig30 56696 56757 2 62 AC177819.2-Contig30 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 53766 60960 55570 AC177819.2-Contig30 57079 57130 1 52 AC177819.2-Contig30 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 53766 60960 55570 AC177819.2-Contig30 60748 60806 2 59 AC177819.2-Contig30 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 53766 60960 55570 AC177819.2-Contig30 61320 61451 1 132 AC177819.2-Contig30 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 60961 64919 24853 AC177819.2-Contig30 62871 62907 1 37 AC177819.2-Contig30 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 60961 64919 24853 AC177819.2-Contig30 63775 63857 1 83 AC177819.2-Contig30 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 60961 64919 24853 AC177819.2-Contig30 70423 70522 1 100 AC177819.2-Contig30 ji_092E12-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 64920 77132 84221 AC177819.2-Contig30 78796 78865 1 70 AC177819.2-Contig30 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 77133 81055 31810 AC177819.2-Contig30 80152 80333 1 182 AC177819.2-Contig30 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 77133 81055 31810 AC177819.2-Contig49 989 1061 1 73 AC177819.2-Contig49 giepum_ac145452-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 39 2094 13872 AC177819.2-Contig49 7075 7119 3 45 AC177819.2-Contig49 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 6802 16888 79815 AC177819.2-Contig49 7691 7726 1 36 AC177819.2-Contig49 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 6802 16888 79815 AC177819.2-Contig49 10790 10834 1 45 AC177819.2-Contig49 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 6802 16888 79815 AC177819.2-Contig49 11104 11269 1 166 AC177819.2-Contig49 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 6802 16888 79815 AC177819.2-Contig49 11695 11810 1 116 AC177819.2-Contig49 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 6802 16888 79815 AC177819.2-Contig49 15969 16029 1 61 AC177819.2-Contig49 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 6802 16888 79815 AC177819.2-Contig49 16030 16118 2 89 AC177819.2-Contig49 Zm1S_23L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 6802 16888 79815 AC177819.2-Contig49 22233 22306 1 74 AC177819.2-Contig49 Zm_AC148112.7_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 22105 23429 8049 AC177819.2-Contig49 38702 38794 1 93 AC177819.2-Contig49 NO_REPEATS AC177819.2-Contig49 38796 39080 3 285 AC177819.2-Contig49 NO_REPEATS AC177819.2-Contig49 45871 46067 2 197 AC177819.2-Contig49 NO_REPEATS AC177819.2-Contig49 49116 49324 2 209 AC177819.2-Contig49 Zm_AC148161.3_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 48982 51639 15265 AC177819.2-Contig49 62986 63165 2 180 AC177819.2-Contig49 Zm1S_138L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 60834 63451 12083 AC177819.2-Contig49 71432 71602 1 171 AC177819.2-Contig49 NO_REPEATS AC177819.2-Contig49 84008 84066 1 59 AC177819.2-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 80673 94510 97971 AC177819.2-Contig49 84384 84443 4 60 AC177819.2-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 80673 94510 97971 AC177819.2-Contig49 85534 85589 1 56 AC177819.2-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 80673 94510 97971 AC177819.2-Contig49 90771 90821 2 51 AC177819.2-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 80673 94510 97971 AC177819.2-Contig49 92574 92634 1 61 AC177819.2-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 80673 94510 97971 AC177819.2-Contig49 92694 92745 1 52 AC177819.2-Contig49 Zm9L_28L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 80673 94510 97971 AC177820.3-Contig134 3298 3346 1 49 AC177820.3-Contig134 Zm_AC148179.4_2L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 3119 4819 12612 AC177820.3-Contig134 3719 3774 1 56 AC177820.3-Contig134 Zm_AC148179.4_2L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 3119 4819 12612 AC177820.3-Contig180 72 231 2 160 AC177820.3-Contig180 NO_REPEATS AC177820.3-Contig180 905 963 1 59 AC177820.3-Contig180 TNR2A MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 860 922 283 AC177820.3-Contig180 1272 1444 1 173 AC177820.3-Contig180 NO_REPEATS AC177820.3-Contig180 9429 9599 2 171 AC177820.3-Contig180 trep2212 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.02.05 LINE 8161 11323 4375 AC177820.3-Contig181 3070 3395 2 326 AC177820.3-Contig181 NO_REPEATS AC177820.3-Contig181 8856 9042 1 187 AC177820.3-Contig181 Zm9L_112L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7626 9840 10076 AC177820.3-Contig181 9592 9692 1 101 AC177820.3-Contig181 Zm9L_112L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 7626 9840 10076 AC177820.3-Contig181 11570 11646 1 77 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 12085 12146 2 62 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 14919 15066 7 148 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 15904 16010 3 107 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 16077 16128 6 52 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 16244 16406 2 163 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 16408 16468 1 61 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 16750 16834 1 85 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 17544 17627 2 84 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147791.1_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 10974 20393 79338 AC177820.3-Contig181 24710 24765 1 56 AC177820.3-Contig181 Zm9L_8L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 20623 25426 32530 AC177820.3-Contig181 28642 28701 2 60 AC177820.3-Contig181 ji_ac145727-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 25427 32992 57685 AC177820.3-Contig181 29755 29813 1 59 AC177820.3-Contig181 ji_ac145727-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 25427 32992 57685 AC177820.3-Contig181 30672 30721 1 50 AC177820.3-Contig181 ji_ac145727-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 25427 32992 57685 AC177820.3-Contig181 32669 32718 1 50 AC177820.3-Contig181 ji_ac145727-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 25427 32992 57685 AC177820.3-Contig181 35230 35278 2 49 AC177820.3-Contig181 opie_092E12-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32993 39750 48105 AC177820.3-Contig181 37082 37133 1 52 AC177820.3-Contig181 opie_092E12-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 32993 39750 48105 AC177820.3-Contig181 41080 41131 1 52 AC177820.3-Contig181 grande_464F01-1part MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.06 grande 39751 50730 75397 AC177820.3-Contig181 42866 42943 1 78 AC177820.3-Contig181 grande_464F01-1part MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.06 grande 39751 50730 75397 AC177820.3-Contig181 46615 46681 1 67 AC177820.3-Contig181 grande_464F01-1part MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.06 grande 39751 50730 75397 AC177820.3-Contig181 51572 51628 2 57 AC177820.3-Contig181 ruda_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 50731 57106 49610 AC177820.3-Contig181 52122 52202 2 81 AC177820.3-Contig181 ruda_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 50731 57106 49610 AC177820.3-Contig181 53688 53739 1 52 AC177820.3-Contig181 ruda_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 50731 57106 49610 AC177820.3-Contig181 54489 54552 1 64 AC177820.3-Contig181 ruda_ac148163-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 50731 57106 49610 AC177820.3-Contig181 61539 61683 1 145 AC177820.3-Contig181 opie_092E12-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 60358 62710 16762 AC177820.3-Contig181 64242 64415 6 174 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 64689 64747 1 59 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 65499 65555 2 57 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 65922 66011 1 90 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 66255 66555 14 301 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 66798 66900 3 103 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 67134 67234 3 101 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 67510 67594 1 85 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 67650 67704 1 55 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 68028 68122 3 95 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 68997 69060 2 64 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 69345 69456 11 112 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 69681 69741 1 61 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 70976 71032 1 57 AC177820.3-Contig181 opie_276N13-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 62711 71626 65362 AC177820.3-Contig181 82663 82721 2 59 AC177820.3-Contig181 ji_ac145727-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 82559 83434 6750 AC177820.3-Contig181 85532 85588 3 57 AC177820.3-Contig181 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 84554 94431 70159 AC177820.3-Contig181 88254 88326 1 73 AC177820.3-Contig181 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 84554 94431 70159 AC177820.3-Contig181 88383 88470 2 88 AC177820.3-Contig181 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 84554 94431 70159 AC177820.3-Contig181 89320 89490 7 171 AC177820.3-Contig181 ji_ac148234-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 84554 94431 70159 AC177820.3-Contig181 96823 96879 1 57 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147015.8_5L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 96150 99868 24451 AC177820.3-Contig181 97291 97361 3 71 AC177820.3-Contig181 Zm_AC147015.8_5L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 96150 99868 24451 AC177820.3-Contig181 101849 101910 1 62 AC177820.3-Contig181 cinful_ay574035-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 99869 102864 24999 AC177820.3-Contig181 106157 106279 1 123 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 106341 106393 1 53 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 111696 111850 2 155 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 112231 112305 1 75 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 112494 112711 2 218 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 112748 112856 1 109 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 113069 113119 1 51 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 113270 113562 4 293 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 113730 113792 1 63 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 114119 114183 1 65 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 114186 114353 1 168 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 114446 114522 1 77 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 114639 114827 2 189 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 115842 115947 1 106 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 116968 117121 1 154 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 117996 118051 1 56 AC177820.3-Contig181 giepum_ac146811-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 105909 118672 113035 AC177820.3-Contig181 122265 122516 1 252 AC177820.3-Contig181 zeon_ac147814-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 118673 122996 32571 AC177820.3-Contig188 256 346 1 91 AC177820.3-Contig188 Zm_AC148179.4_2L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 6 1916 14977 AC177820.3-Contig188 520 572 3 53 AC177820.3-Contig188 Zm_AC148179.4_2L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 6 1916 14977 AC177820.3-Contig188 790 849 1 60 AC177820.3-Contig188 Zm_AC148179.4_2L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 6 1916 14977 AC177820.3-Contig188 934 991 1 58 AC177820.3-Contig188 Zm_AC148179.4_2L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 6 1916 14977 AC177820.3-Contig188 1138 1210 3 73 AC177820.3-Contig188 Zm_AC148179.4_2L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 6 1916 14977 AC177820.3-Contig192 6395 6435 1 41 AC177820.3-Contig192 Zm_AC148294.2_1L_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 4739 14337 82547 AC177820.3-Contig192 8030 8115 1 86 AC177820.3-Contig192 Zm_AC148294.2_1L_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 4739 14337 82547 AC177820.3-Contig193 2843 2901 1 59 AC177820.3-Contig193 Zm_AC146762.2_4L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 1577 18347 56421 AC177820.3-Contig193 8862 8939 1 78 AC177820.3-Contig193 Zm_AC146762.2_4L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 1577 18347 56421 AC177820.3-Contig193 18571 18728 1 158 AC177820.3-Contig193 giepum_438D03-2solo MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.11 giepum 18450 19123 1895 AC177820.3-Contig193 28869 29002 1 134 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 30314 30355 1 42 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 30730 30786 2 57 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 31351 31442 1 92 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 31533 31589 1 57 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 31601 31647 1 47 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 31730 31791 1 62 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 31934 32004 1 71 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 32677 32739 1 63 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 32926 32981 1 56 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 32982 33106 1 125 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 33141 33230 1 90 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 33407 33492 1 86 AC177820.3-Contig193 doke_AC147789-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 28102 39512 64993 AC177820.3-Contig193 48983 49052 1 70 AC177820.3-Contig193 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 624 825 1 202 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 4076 4209 1 134 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 5538 5774 1 237 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 6717 6804 1 88 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 9477 9704 3 228 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 9816 10069 1 254 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 10308 10390 1 83 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 13380 13493 1 114 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig194 13771 13905 1 135 AC177820.3-Contig194 NO_REPEATS AC177820.3-Contig52 341 426 1 86 AC177820.3-Contig52 Zm9L_13L_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 16 2041 13915 AC177820.3-Contig53 1580 1655 2 76 AC177820.3-Contig53 Zm_AC148172.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 2016 15780 AC177820.3-Contig53 1702 1812 2 111 AC177820.3-Contig53 Zm_AC148172.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 2016 15780 AC177820.3-Contig65 1859 2021 1 163 AC177820.3-Contig65 NO_REPEATS AC177820.3-Contig68 1794 1843 2 50 AC177820.3-Contig68 Zm1S_139L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1195 7383 32074 AC177820.3-Contig68 2642 2695 1 54 AC177820.3-Contig68 Zm1S_139L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1195 7383 32074 AC177820.3-Contig68 4575 4655 1 81 AC177820.3-Contig68 Zm1S_139L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1195 7383 32074 AC177820.3-Contig69 691 754 1 64 AC177820.3-Contig69 ji_ac145262-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 2544 21452 AC177820.3-Contig69 1139 1208 10 70 AC177820.3-Contig69 ji_ac145262-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 2544 21452 AC177820.3-Contig69 1379 1440 2 62 AC177820.3-Contig69 ji_ac145262-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 2544 21452 AC177820.3-Contig69 1441 1490 1 50 AC177820.3-Contig69 ji_ac145262-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 2544 21452 AC177820.3-Contig69 1882 1958 1 77 AC177820.3-Contig69 ji_ac145262-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 2544 21452 AC177820.3-Contig69 1997 2095 4 99 AC177820.3-Contig69 ji_ac145262-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 2544 21452 AC177820.3-Contig69 2349 2389 1 41 AC177820.3-Contig69 ji_ac145262-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 2544 21452 AC177820.3-Contig69 3393 3427 1 35 AC177820.3-Contig69 machiavelli_ac145226-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.05 machiavell 2545 3990 13151 AC177820.3-Contig71 1191 1255 1 65 AC177820.3-Contig71 opie_092E12-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1 4958 34593 AC177820.3-Contig72 51 147 2 97 AC177820.3-Contig72 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1 4024 30528 AC177820.3-Contig72 819 874 1 56 AC177820.3-Contig72 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1 4024 30528 AC177820.3-Contig72 1692 1755 2 64 AC177820.3-Contig72 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1 4024 30528 AC177820.3-Contig72 1757 1822 9 66 AC177820.3-Contig72 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1 4024 30528 AC177820.3-Contig72 13989 14082 1 94 AC177820.3-Contig72 Zm_AC147015.8_6L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.06 grande 4849 14201 67587 AC177821.2-Contig16 6653 6902 1 250 AC177821.2-Contig16 uwum_573F08-1 MIPS/REcat Other 98 other 4567 7126 16804 AC177821.2-Contig18 4558 4604 1 47 AC177821.2-Contig18 Zm_AC148173.2_7L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1385 7715 40495 AC177821.2-Contig18 5236 5429 1 194 AC177821.2-Contig18 Zm_AC148173.2_7L_A MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1385 7715 40495 AC177821.2-Contig25 3707 3847 2 141 AC177821.2-Contig25 prem1_123C01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1 4737 22202 AC177821.2-Contig25 4413 4463 1 51 AC177821.2-Contig25 prem1_123C01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1 4737 22202 AC177821.2-Contig25 4656 4729 1 74 AC177821.2-Contig25 prem1_123C01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1 4737 22202 AC177821.2-Contig25 16735 16802 1 68 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 16978 17083 2 106 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 17422 17487 1 66 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 19990 20084 1 95 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 20946 21057 1 112 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 21951 22050 2 100 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 22786 22843 1 58 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 26004 26049 1 46 AC177821.2-Contig25 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15966 26830 69373 AC177821.2-Contig25 28075 28213 1 139 AC177821.2-Contig25 zeon_ac145228-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 26831 29305 21624 AC177821.2-Contig25 28214 28330 1 117 AC177821.2-Contig25 zeon_ac145228-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 26831 29305 21624 AC177821.2-Contig25 28336 28433 1 98 AC177821.2-Contig25 zeon_ac145228-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 26831 29305 21624 AC177821.2-Contig25 33280 33396 2 117 AC177821.2-Contig25 Zm1S_75L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 32070 34863 19724 AC177821.2-Contig25 33646 33683 1 38 AC177821.2-Contig25 Zm1S_75L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 32070 34863 19724 AC177821.2-Contig25 37369 37425 3 57 AC177821.2-Contig25 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 36433 44745 51027 AC177821.2-Contig25 39145 39225 2 81 AC177821.2-Contig25 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 36433 44745 51027 AC177821.2-Contig25 40400 40468 1 69 AC177821.2-Contig25 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 36433 44745 51027 AC177821.2-Contig25 40515 40645 9 131 AC177821.2-Contig25 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 36433 44745 51027 AC177821.2-Contig25 40655 40735 1 81 AC177821.2-Contig25 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 36433 44745 51027 AC177821.2-Contig25 44522 44580 2 59 AC177821.2-Contig25 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 36433 44745 51027 AC177821.2-Contig25 44667 44725 1 59 AC177821.2-Contig25 Zm_AC146762.2_6L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 36433 44745 51027 AC177821.2-Contig26 2771 2980 3 210 AC177821.2-Contig26 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 1 3624 19990 AC177821.2-Contig26 3051 3118 1 68 AC177821.2-Contig26 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 1 3624 19990 AC177821.2-Contig27 523 570 1 48 AC177821.2-Contig27 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 37 3791 29514 AC177821.2-Contig41 1661 1728 1 68 AC177821.2-Contig41 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 638 2409 13422 AC177821.2-Contig41 1799 2008 3 210 AC177821.2-Contig41 Zm_AC145481.9_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 638 2409 13422 AC177821.2-Contig76 1986 2053 1 68 AC177821.2-Contig76 Zm_AC148093.6_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 7 2733 17309 AC177821.2-Contig76 4855 4960 1 106 AC177821.2-Contig76 zeon_5BL-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 2734 10078 66264 AC177821.2-Contig76 5085 5262 1 178 AC177821.2-Contig76 zeon_5BL-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 2734 10078 66264 AC177821.2-Contig76 12849 12899 1 51 AC177821.2-Contig76 Zm_AC148100.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 11548 17753 45451 AC177821.2-Contig76 16507 16571 1 65 AC177821.2-Contig76 Zm_AC148100.2_3L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 11548 17753 45451 AC177821.2-Contig76 22293 22382 1 90 AC177821.2-Contig76 Zm1S_16L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.16 milt 19819 23133 25042 AC177821.2-Contig76 43665 43728 6 64 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 44150 44321 2 172 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 44678 44729 1 52 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 45240 45368 7 129 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 45394 45454 3 61 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 45511 45714 11 204 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 47582 47638 1 57 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 47660 47709 1 50 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig76 50028 50086 1 59 AC177821.2-Contig76 xilon_333J11-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 42065 51693 75716 AC177821.2-Contig78 593 893 2 301 AC177821.2-Contig78 Zm9L_53L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 3 1955 16140 AC177821.2-Contig78 896 1071 7 176 AC177821.2-Contig78 Zm9L_53L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 3 1955 16140 AC177821.2-Contig78 1449 1552 1 104 AC177821.2-Contig78 Zm9L_53L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 3 1955 16140 AC177821.2-Contig78 1794 1902 1 109 AC177821.2-Contig78 Zm9L_53L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 3 1955 16140 AC177821.2-Contig78 25040 25097 1 58 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 25178 25276 8 99 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 25302 25430 10 129 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 25633 25734 3 102 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 26029 26133 1 105 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 26233 26293 1 61 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 26609 26687 2 79 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 26785 26837 2 53 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 26998 27054 1 57 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 27062 27231 2 170 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 27232 27281 2 50 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 27497 27597 3 101 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 27881 27935 1 55 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 28250 28299 1 50 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig78 28300 28476 8 177 AC177821.2-Contig78 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 23071 28725 47766 AC177821.2-Contig84 97 216 1 120 AC177821.2-Contig84 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 38 3257 27922 AC177821.2-Contig84 1203 1265 1 63 AC177821.2-Contig84 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 38 3257 27922 AC177821.2-Contig84 1306 1544 1 239 AC177821.2-Contig84 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 38 3257 27922 AC177821.2-Contig84 1939 1994 1 56 AC177821.2-Contig84 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 38 3257 27922 AC177821.2-Contig84 2784 2849 2 66 AC177821.2-Contig84 opie_ac148350-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 38 3257 27922 AC177821.2-Contig84 16367 16461 1 95 AC177821.2-Contig84 NO_REPEATS AC177821.2-Contig84 16795 17252 11 458 AC177821.2-Contig84 NO_REPEATS AC177821.2-Contig84 20339 20600 3 262 AC177821.2-Contig84 Zm9L_49L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 19801 20346 4455 AC177822.3-Contig431 2103 2271 1 169 AC177822.3-Contig431 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 22 6055 23502 AC177822.3-Contig431 2291 2506 9 216 AC177822.3-Contig431 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 22 6055 23502 AC177822.3-Contig431 2509 2623 3 115 AC177822.3-Contig431 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 22 6055 23502 AC177822.3-Contig431 4368 4436 1 69 AC177822.3-Contig431 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 22 6055 23502 AC177822.3-Contig431 4936 5032 2 97 AC177822.3-Contig431 Zm1S_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 22 6055 23502 AC177822.3-Contig457 8540 8609 1 70 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 8954 9010 2 57 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 9607 9692 1 86 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 9733 9907 9 175 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 10179 10317 1 139 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 13612 13682 3 71 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 13797 13868 1 72 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 13919 14009 4 91 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 14216 14276 1 61 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 14350 14397 1 48 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 14913 14977 1 65 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 16258 16335 2 78 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 16611 16699 4 89 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 17443 17565 1 123 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 17919 17977 1 59 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 19008 19113 3 106 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 20057 20123 1 67 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 20286 20345 1 60 AC177822.3-Contig457 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 7926 20378 66536 AC177822.3-Contig457 22417 22499 1 83 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 22508 22598 1 91 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 25729 25797 1 69 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 31616 31726 1 111 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 33419 33520 1 102 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 37571 37697 1 127 AC177822.3-Contig457 Zm1S_136L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05 Ty1/copia 33827 38177 29329 AC177822.3-Contig457 40338 40472 3 135 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 40526 40614 1 89 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 41721 41889 1 169 AC177822.3-Contig457 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 41252 41785 1426 AC177822.3-Contig457 41909 42124 9 216 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 42127 42241 3 115 AC177822.3-Contig457 NO_REPEATS AC177822.3-Contig457 43986 44054 1 69 AC177822.3-Contig457 prem1_573F08-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 42626 44677 12963 AC177822.3-Contig457 44554 44650 2 97 AC177822.3-Contig457 prem1_573F08-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 42626 44677 12963 AC177822.3-Contig457 54731 54964 2 234 AC177822.3-Contig457 HELITRON4_OS MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.10.01 Helitron 52496 55520 9704 AC177822.3-Contig457 61365 61420 1 56 AC177822.3-Contig457 zeon_af546186-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 55521 62802 55193 AC177822.3-Contig457 61694 61804 2 111 AC177822.3-Contig457 zeon_af546186-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 55521 62802 55193 AC177822.3-Contig457 62881 62951 1 71 AC177822.3-Contig457 HELITRON4_OS MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.10.01 Helitron 62803 63607 1584 AC177822.3-Contig457 66089 66144 1 56 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 67196 67267 1 72 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 67728 67805 1 78 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 67938 67988 1 51 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 67990 68061 6 72 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 68132 68172 1 41 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 68456 68519 2 64 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 69018 69109 2 92 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 69812 69866 1 55 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 70194 70239 1 46 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 71011 71084 3 74 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 71085 71174 3 90 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 72073 72153 1 81 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 72990 73185 4 196 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 73269 73350 1 82 AC177822.3-Contig457 Zm_AC148294.2_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 65859 74800 72724 AC177822.3-Contig457 91302 91372 1 71 AC177822.3-Contig457 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 87861 92436 31819 AC177822.3-Contig457 92233 92333 1 101 AC177822.3-Contig457 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 87861 92436 31819 AC177822.3-Contig47 2714 2804 1 91 AC177822.3-Contig47 xilon_333J11-2hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.14 xilon 23 3043 21130 AC177822.3-Contig476 5614 5689 1 76 AC177822.3-Contig476 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 408 6647 29822 AC177822.3-Contig476 6219 6335 1 117 AC177822.3-Contig476 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 408 6647 29822 AC177822.3-Contig476 11091 11181 1 91 AC177822.3-Contig476 NO_REPEATS AC177822.3-Contig476 14308 14382 1 75 AC177822.3-Contig476 NO_REPEATS AC177822.3-Contig476 26582 26635 1 54 AC177822.3-Contig476 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25014 38638 100127 AC177822.3-Contig476 26698 26756 2 59 AC177822.3-Contig476 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25014 38638 100127 AC177822.3-Contig476 28290 28338 1 49 AC177822.3-Contig476 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25014 38638 100127 AC177822.3-Contig476 32589 32654 2 66 AC177822.3-Contig476 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25014 38638 100127 AC177822.3-Contig476 36187 36244 1 58 AC177822.3-Contig476 Zm_AC146974.4_2L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 25014 38638 100127 AC177822.3-Contig476 38777 38841 1 65 AC177822.3-Contig476 Zm_AC146813.3_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 38800 41370 6541 AC177822.3-Contig476 45615 45703 1 89 AC177822.3-Contig476 Zm1S_146L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 41371 50771 81243 AC177822.3-Contig476 49570 49739 1 170 AC177822.3-Contig476 Zm1S_146L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 41371 50771 81243 AC177822.3-Contig78 380 430 1 51 AC177822.3-Contig78 Zm9L_62L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1 1358 11413 AC177822.3-Contig78 476 554 2 79 AC177822.3-Contig78 Zm9L_62L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 1 1358 11413 AC177822.3-Contig78 4321 4413 1 93 AC177822.3-Contig78 Zm_AC147602.5_7L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 2928 5202 18112 AC177822.3-Contig78 5571 5776 9 206 AC177822.3-Contig78 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 5203 10391 12431 AC177822.3-Contig78 6092 6160 1 69 AC177822.3-Contig78 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 5203 10391 12431 AC177822.3-Contig78 8420 8491 1 72 AC177822.3-Contig78 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 5203 10391 12431 AC177822.3-Contig78 9056 9123 1 68 AC177822.3-Contig78 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 5203 10391 12431 AC177822.3-Contig78 9322 9436 2 115 AC177822.3-Contig78 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 5203 10391 12431 AC177822.3-Contig78 9783 9852 1 70 AC177822.3-Contig78 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 5203 10391 12431 AC177822.3-Contig78 10455 10505 1 51 AC177822.3-Contig78 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 10392 13811 28065 AC177822.3-Contig78 11250 11306 2 57 AC177822.3-Contig78 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 10392 13811 28065 AC177822.3-Contig78 11597 11648 1 52 AC177822.3-Contig78 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 10392 13811 28065 AC177822.3-Contig78 12120 12177 2 58 AC177822.3-Contig78 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 10392 13811 28065 AC177822.3-Contig78 12232 12294 5 63 AC177822.3-Contig78 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 10392 13811 28065 AC177822.3-Contig78 12295 12348 2 54 AC177822.3-Contig78 huck_ac148093-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 10392 13811 28065 AC177822.3-Contig84 1148 1201 1 54 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 1554 1614 1 61 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 2111 2167 1 57 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 2219 2337 4 119 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 2411 2458 1 48 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 3160 3264 2 105 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 3460 3513 1 54 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 3577 3633 1 57 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 3977 4090 4 114 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 4252 4318 1 67 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 4378 4444 1 67 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 4843 5002 2 160 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 5005 5055 1 51 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 5315 5365 1 51 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 5397 5470 3 74 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 5919 6019 11 101 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 6153 6227 2 75 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 6288 6354 1 67 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 6965 7044 1 80 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 7338 7404 2 67 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 8116 8166 1 51 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 8911 8967 2 57 AC177822.3-Contig84 huck_ac145263-1hdnm MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 1 9655 74524 AC177822.3-Contig84 10963 11015 1 53 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 9656 15498 38535 AC177822.3-Contig84 12401 12450 1 50 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 9656 15498 38535 AC177822.3-Contig84 13344 13440 2 97 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 9656 15498 38535 AC177822.3-Contig84 14317 14367 1 51 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 9656 15498 38535 AC177822.3-Contig84 14607 14664 1 58 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 9656 15498 38535 AC177822.3-Contig84 14814 14900 2 87 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 9656 15498 38535 AC177822.3-Contig84 15556 15761 9 206 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15503 16850 8590 AC177822.3-Contig84 16077 16145 1 69 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 15503 16850 8590 AC177822.3-Contig84 19308 19422 2 115 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147016.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 16832 19788 8010 AC177822.3-Contig84 21100 21149 1 50 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147602.5_7L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 19789 23606 29724 AC177822.3-Contig84 21841 21896 1 56 AC177822.3-Contig84 Zm_AC147602.5_7L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 19789 23606 29724 AC177823.2-Contig11 2685 2780 1 96 AC177823.2-Contig11 Zm9L_58L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 1661 3315 12817 AC177823.2-Contig11 5014 5067 1 54 AC177823.2-Contig11 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 4096 6280 16808 AC177823.2-Contig11 5444 5512 1 69 AC177823.2-Contig11 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 4096 6280 16808 AC177823.2-Contig11 6148 6243 2 96 AC177823.2-Contig11 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 4096 6280 16808 AC177823.2-Contig12 3596 3674 2 79 AC177823.2-Contig12 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 3499 5413 7783 AC177823.2-Contig12 3752 3801 2 50 AC177823.2-Contig12 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 3499 5413 7783 AC177823.2-Contig12 4025 4100 1 76 AC177823.2-Contig12 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 3499 5413 7783 AC177823.2-Contig12 4815 4872 1 58 AC177823.2-Contig12 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 3499 5413 7783 AC177823.2-Contig12 6013 6135 1 123 AC177823.2-Contig12 ZRSiTERT00100076 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 6025 6218 1598 AC177823.2-Contig12 6730 7065 6 336 AC177823.2-Contig12 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 6314 7942 11685 AC177823.2-Contig12 7406 7501 1 96 AC177823.2-Contig12 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 6314 7942 11685 AC177823.2-Contig12 8002 8060 1 59 AC177823.2-Contig12 trep773 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05.01.04.01 En/Spm 7425 9676 5074 AC177823.2-Contig12 8187 8327 1 141 AC177823.2-Contig12 trep773 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05.01.04.01 En/Spm 7425 9676 5074 AC177823.2-Contig12 8714 8793 1 80 AC177823.2-Contig12 ZRSiTERT00100076 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 8787 9732 8492 AC177823.2-Contig12 9527 9573 1 47 AC177823.2-Contig12 ZRSiTERT00100076 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 8787 9732 8492 AC177823.2-Contig13 788 886 1 99 AC177823.2-Contig13 Zm_AC145226.4_1L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 560 998 693 AC177823.2-Contig14 3026 3080 1 55 AC177823.2-Contig14 Zm_AC148093.6_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 116 8602 42992 AC177823.2-Contig15 385 451 3 67 AC177823.2-Contig15 ruda_ac147808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 1 3712 33064 AC177823.2-Contig15 668 729 1 62 AC177823.2-Contig15 ruda_ac147808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 1 3712 33064 AC177823.2-Contig15 1700 1786 2 87 AC177823.2-Contig15 ruda_ac147808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 1 3712 33064 AC177823.2-Contig15 2522 2598 1 77 AC177823.2-Contig15 ruda_ac147808-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 1 3712 33064 AC177823.2-Contig15 10656 10744 1 89 AC177823.2-Contig15 tekay_334B07-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.12 tekay 7030 11740 36399 AC177823.2-Contig16 517 612 2 96 AC177823.2-Contig16 misfit_af391808-1 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05 Class II: DNA Transposon 21 649 4805 AC177823.2-Contig16 1661 1794 1 134 AC177823.2-Contig16 NO_REPEATS AC177823.2-Contig16 1805 1932 1 128 AC177823.2-Contig16 NO_REPEATS AC177823.2-Contig16 2395 2490 1 96 AC177823.2-Contig16 NO_REPEATS AC177823.2-Contig16 9566 9630 1 65 AC177823.2-Contig16 Zm9L_116L_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.06 grande 7664 14783 38073 AC177823.2-Contig17 1881 1976 2 96 AC177823.2-Contig17 cinful_ac147604-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 936 10457 82386 AC177823.2-Contig17 2098 2143 1 46 AC177823.2-Contig17 cinful_ac147604-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 936 10457 82386 AC177823.2-Contig17 2368 2473 1 106 AC177823.2-Contig17 cinful_ac147604-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 936 10457 82386 AC177823.2-Contig17 4657 4723 3 67 AC177823.2-Contig17 cinful_ac147604-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 936 10457 82386 AC177823.2-Contig17 5092 5247 2 156 AC177823.2-Contig17 cinful_ac147604-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 936 10457 82386 AC177823.2-Contig17 13580 13639 1 60 AC177823.2-Contig17 Zm9L_69L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 12609 13712 6754 AC177823.2-Contig17 30059 30249 1 191 AC177823.2-Contig17 opie_178A11-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 28889 31940 18180 AC177823.2-Contig19 1882 2015 1 134 AC177823.2-Contig19 NO_REPEATS AC177823.2-Contig19 6651 6715 1 65 AC177823.2-Contig19 NO_REPEATS AC177823.2-Contig199 6241 6295 1 55 AC177823.2-Contig199 Zm_AC148093.6_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 2657 6820 18441 AC177823.2-Contig20 4612 4663 1 52 AC177823.2-Contig20 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 2350 11520 70186 AC177823.2-Contig20 4712 4776 8 65 AC177823.2-Contig20 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 2350 11520 70186 AC177823.2-Contig20 6000 6064 2 65 AC177823.2-Contig20 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 2350 11520 70186 AC177823.2-Contig20 9677 9736 1 60 AC177823.2-Contig20 opie_138B04-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 2350 11520 70186 AC177823.2-Contig20 25436 25483 1 48 AC177823.2-Contig20 Zm_AC146814.6_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 24111 26065 14601 AC177823.2-Contig20 35642 35692 1 51 AC177823.2-Contig20 Zm_AC146814.6_2L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01 LTR Retrotransposon 33469 37220 24988 AC177823.2-Contig20 41040 41116 1 77 AC177823.2-Contig20 ruda_464F01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.99 unclassified LTR 40834 43580 22890 AC177823.2-Contig20 42202 42282 2 81 AC177823.2-Contig20 ruda_464F01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.99 unclassified LTR 40834 43580 22890 AC177823.2-Contig202 2852 2906 1 55 AC177823.2-Contig202 Zm_AC148093.6_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10 Ty3/gypsy 1 3431 18337 AC177823.2-Contig202 8695 8745 1 51 AC177823.2-Contig202 Zm1S_44L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 3432 13127 82576 AC177823.2-Contig202 9192 9474 8 283 AC177823.2-Contig202 Zm1S_44L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 3432 13127 82576 AC177823.2-Contig202 11350 11462 2 113 AC177823.2-Contig202 Zm1S_44L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 3432 13127 82576 AC177823.2-Contig202 11813 11969 1 157 AC177823.2-Contig202 Zm1S_44L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.04 cinful 3432 13127 82576 AC177823.2-Contig8 3247 3297 1 51 AC177823.2-Contig8 Zm_AC145228.9_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.01 prem1 22 3433 27552 AC177824.1-Contig11 243 330 1 88 AC177824.1-Contig11 ji_092E12-3part MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.04 ji 1 990 6374 AC177824.1-Contig11 3953 4077 1 125 AC177824.1-Contig11 ZRSiTETNOOT00001 MIPS/REcat Class II/III Transposable Ele 02.05.01.99 unclassified 3946 5065 5224 AC177824.1-Contig14 1548 1625 1 78 AC177824.1-Contig14 Zm9L_110L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 852 8239 62043 AC177824.1-Contig14 2317 2455 3 139 AC177824.1-Contig14 Zm9L_110L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 852 8239 62043 AC177824.1-Contig14 2803 2865 2 63 AC177824.1-Contig14 Zm9L_110L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 852 8239 62043 AC177824.1-Contig14 6492 6630 1 139 AC177824.1-Contig14 Zm9L_110L_A_WD MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.13 zeon 852 8239 62043 AC177824.1-Contig15 595 784 2 190 AC177824.1-Contig15 huck_464F01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 590 2317 14741 AC177824.1-Contig15 981 1043 1 63 AC177824.1-Contig15 huck_464F01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 590 2317 14741 AC177824.1-Contig15 1234 1290 2 57 AC177824.1-Contig15 huck_464F01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 590 2317 14741 AC177824.1-Contig15 2205 2255 1 51 AC177824.1-Contig15 huck_464F01-1 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 590 2317 14741 AC177824.1-Contig15 7188 7254 1 67 AC177824.1-Contig15 NO_REPEATS AC177824.1-Contig15 18360 18405 1 46 AC177824.1-Contig15 NO_REPEATS AC177824.1-Contig15 19758 19805 1 48 AC177824.1-Contig15 opie_178A11-2 MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.06 opie 18915 27804 61099 AC177824.1-Contig15 51314 51378 1 65 AC177824.1-Contig15 Zm_AC148172.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 50537 57868 57771 AC177824.1-Contig15 52271 52337 2 67 AC177824.1-Contig15 Zm_AC148172.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 50537 57868 57771 AC177824.1-Contig15 54021 54089 4 69 AC177824.1-Contig15 Zm_AC148172.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 50537 57868 57771 AC177824.1-Contig15 55649 55717 1 69 AC177824.1-Contig15 Zm_AC148172.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 50537 57868 57771 AC177824.1-Contig15 56281 56336 1 56 AC177824.1-Contig15 Zm_AC148172.3_4L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 50537 57868 57771 AC177824.1-Contig15 63746 63808 1 63 AC177824.1-Contig15 Zm1S_139L_UI MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.10.07 huck 57869 64712 38157 AC177824.1-Contig16 11054 11204 1 151 AC177824.1-Contig16 NO_REPEATS AC177824.1-Contig16 23430 23532 2 103 AC177824.1-Contig16 Zm_AC148480.2_5L MIPS/REcat Class I Retroelements 02.01.01.05.98 other copia 22731 30502